本項研究的目的是雙重的,首先從植物高度 (PH) 和植被指數(shù) (VI) 圖中確定預(yù)測番茄產(chǎn)量的重要變量。這些地圖來自無人機(jī) (UAV) 拍攝的圖像。其次,使用選定的變量集,檢驗多機(jī)器學(xué)習(xí)算法對番茄鮮枝質(zhì)量(SM)、果實(shí)重量(FW)和果實(shí)數(shù)量(FN)的預(yù)測準(zhǔn)確性。為了實(shí)現(xiàn)目標(biāo),無人機(jī)在 2020 年番茄生長季節(jié)的十天內(nèi)收集了超高分辨率 RGB 和多光譜圖像。從這些圖像中,作者提取了756個總變量,包括每種植物的一階(如平均值、標(biāo)準(zhǔn)差、偏度、范圍和最大值)和二階(如灰度共生矩陣特征和PH和VIs的生長率)統(tǒng)計數(shù)據(jù)。使用幾種選擇算法(即Boruta、DALEX、遺傳算法、最小絕對收縮和選擇算子以及遞歸特征消除)來選擇對預(yù)測SM、FW和FN有用的變量集。隨機(jī)森林,嶺回歸和支持向量機(jī)被用來預(yù)測產(chǎn)量使用前五個選定的變量集。
本研究中使用的實(shí)驗場。位于日本東京。這張正射影像是使用6月18日拍攝的無人機(jī)影像創(chuàng)建的
在果實(shí)形成早期到中期,大約在收獲前一個月收集的PH和VIs的一階統(tǒng)計數(shù)據(jù)是預(yù)測SM的重要變量。與SM的情況類似,收獲前大約一個月收集的變量對于預(yù)測FW和FN很重要。此外,與 PH 相關(guān)的變量對于預(yù)測并不重要。 與僅用一階統(tǒng)計量得到的預(yù)測結(jié)果相比,用VIs的二階統(tǒng)計量得到的預(yù)測結(jié)果對FW和FN更為準(zhǔn)確。由所有變量構(gòu)建的模型(rRMSE = 8.8-28.1%)對SM、FW和FN的預(yù)測精度優(yōu)于一階統(tǒng)計量模型(rRMSE = 10.0-50.1%)。
利用無人機(jī)和傳感器系統(tǒng)
除了基本統(tǒng)計數(shù)據(jù)(如平均值和標(biāo)準(zhǔn)差),作者還利用超高分辨率無人機(jī)圖像導(dǎo)出了植物水平的PH和VIs的二階統(tǒng)計數(shù)據(jù)。結(jié)果表明,該變量選擇方法減少了番茄產(chǎn)量預(yù)測所需的變量數(shù)量,提高了表型數(shù)據(jù)收集的效率,有助于育種計劃中高產(chǎn)品系的選擇。
來源:Plant Methods.Prediction of plant-level tomato biomass and yield using machine learning with unmanned aerial vehicle imagery.Kenichi Tatsumi, Noa Igarashi & Xiao Mengxue
https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-021-00761-2