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Prospector:便攜式、高通量近紅外光譜表型分析的移動應(yīng)用程序

2022/8/24
品質(zhì)性狀是植物育種計劃中需要評估的一些最重要和最耗時的表型。由于成本原因,這些性狀通常在育種流程的后期進(jìn)行評估,從而導(dǎo)致許多不適合開發(fā)的品系在潛在發(fā)展。


(左)存儲在 Prospector 中的當(dāng)前實(shí)驗(yàn)列表。(中)所選實(shí)驗(yàn)中的樣本列表(例如樣本數(shù)據(jù))。(右)所選樣本中的掃描列表(例如斑豆)

近紅外光譜 (NIRS) 是一種非破壞性方法,可以快速提高評估品質(zhì)特性的速度。然而,大多數(shù)光譜儀不便于攜帶或價格昂貴。近年來的發(fā)展引導(dǎo)了以消費(fèi)者為目標(biāo)的廉價光譜儀的開發(fā),這些光譜儀具有育種應(yīng)用的潛力。

不幸的是,這些光譜儀的移動應(yīng)用程序并非旨在以育種計劃所需的規(guī)模快速收集組織樣本。為此,我們開發(fā)了 Prospector,這是一款移動應(yīng)用程序,可與 LinkSquare 便攜式近紅外 (NIR) 光譜儀連接,并允許育種者有效地捕獲 NIR 數(shù)據(jù)。


Prospector 中的設(shè)置屏幕

在本報告中,我們概述了該應(yīng)用程序的核心功能以及它如何輕松整合到育種工作流程中以及如何進(jìn)一步開發(fā)的。植物育種者需要 Prospector 和其他高通量表型分析工具和技術(shù)來開發(fā)下一代改良品種,以養(yǎng)活不斷增長的全球人口。

來源:The Plant Phenome Journal.Prospector: A mobile application for portable, high-throughput near-infrared spectroscopy phenotyping .Trevor W. Rife,Chaney Courtney,Jenna Hershberger,Michael Allen Gore,Mitchell Neilsen,Jesse Poland
https://doi.org/10.1002/ppj2.20024
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